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DS 系列– TN 168 OD600 測量性能數(shù)據(jù)示例

更新時間:2025-06-30      點擊次數(shù):987

對于 OD600測量時,穿過樣品的光被懸浮在樣品中的細胞向隨機方向散射。這種光散射是特定細胞大小和形狀以及細胞懸液密度的函數(shù)。此外,死細胞和細胞碎片可能會導(dǎo)致光散射。相同密度的不同細胞類型(例如每毫升細胞數(shù))可能導(dǎo)致不同的 OD600值。

光學(xué)配置

分光光度計的光學(xué)配置在特定儀器檢測到的光散射中起著重要作用。不同的 OD600當在具有不同光學(xué)設(shè)置的分光光度計上測量時,將報告相同細菌培養(yǎng)物的值。一個 OD600的 0.8 可以在另一臺儀器上報告為 0.5,而不會在任何一臺設(shè)備上出現(xiàn)錯誤。

換算系數(shù)

DeNovix DS-11 系列分光光度計/熒光計可使用 1 μL 微量模式(適合高密度培養(yǎng)物)或各種光程比色皿模式測量微生物培養(yǎng)物。

 

經(jīng)驗?zāi)繕酥?/span>

許多研究人員依賴靶標 OD600在收獲微生物細胞培養(yǎng)物或確定接種用于蛋白質(zhì)表達研究的培養(yǎng)物的正確密度時從文獻來源獲得的值。遺憾的是,這些目標值可能不適合細胞類型和所用儀器的組合。建議將 OD600使用與 OD 相關(guān)的生長曲線根據(jù)經(jīng)驗確定值600使用新分光光度計時每種細胞類型的板計數(shù)值。

DS-11 微量模式可實現(xiàn)更高的 OD600值使用其獲得特別的自動路徑長度調(diào)整。請記住,微量和比色皿模式使用不同的光學(xué)配置,因此在比較使用兩種模式測量的值時,建立轉(zhuǎn)換因子可能很有用。

最好使用接近所需目標 OD 的測量值來確定因子600價值。酌情考慮稀釋。

可以確定一個等效因子,然后將其應(yīng)用于使用不同分光光度計進行的測量。

示例數(shù)據(jù)

下面的數(shù)據(jù)是一個例子,說明了在不同分光光度計上測量相同的光散射樣品如何導(dǎo)致不同的 OD600 測量值(表 1 和表 2)。

將 Formazin 4000NTU 濁度標準品 (Hach cat #246149) 稀釋 7.7 倍以產(chǎn)生初始儲備液。然后在水中進行一系列 2 倍連續(xù)稀釋。使用一次性比色皿和 2 mL 的相應(yīng)稀釋度測量每種溶液,一式三份。未對 600 nm 測量值進行基線校正。



Table 1: Mean OD600 Values; n=3

SampleAgilent 8453DS-11+
Stock1.15880.8376
Stock 1:20.56960.4245
Stock 1:40.27940.2173
Stock 1:80.13720.1125
Stock 1:160.06840.0594
Stock 1:320.03260.0310
Stock 1:640.01400.0158

Table 2: Precision of Replicate Measurements; n=3

SampleAgilent 8453
% CV
DS-11+
% CV
Stock0.61%0.24%
Stock 1:20.82%1.15%
Stock 1:41.61%2.76%
Stock 1:80.63%1.92%
Stock 1:160.91%3.82%
Stock 1:325.03%8.58%
Stock 1:6411.17%10.82%



線性范圍

基于比色皿的儀器通常具有測得光程的外徑上限約為 1.5。外徑600如此高的值可能不足以覆蓋培養(yǎng)物的整個生長周期,并且在生長方面可能不是線性的。死亡期的培養(yǎng)物可能表現(xiàn)出不同的光散射行為,這可能會影響活細胞密度與測得的 OD 之間的相關(guān)性600值。

因此,必須仔細稀釋培養(yǎng)物,以便繪制整個生長曲線或確定測量值不再與活細胞密度線性相關(guān)的極限。

此外,盡管測得的 OD600值和特定像元密度在兩種不同儀器上的范圍可能重疊,線性線的斜率可能不同。表 1 中的數(shù)據(jù)如下圖所示(圖 1)作為此范式的一個例子。

當使用轉(zhuǎn)換因子將數(shù)據(jù)從一臺儀器關(guān)聯(lián)到另一臺儀器時,可能需要對特定的 OD 范圍使用不同的因子來補償不同的斜率。

注意:盡管斜率不同,但兩種儀器的 R2 值均> 0.9999。

圖 1:福爾馬肼標準品與測得的 OD600 值之間的線性關(guān)系。

OD 600 值和細胞數(shù)

The OD600應(yīng)用程序允許用戶輸入一個細胞數(shù)因子,該因子將乘以測得的 OD600值來計算近似的細胞/mL 濃度。如前所述,OD600值取決于被采樣溶液中細胞的大小和形狀以及細胞密度。一個 OD600值 1 可能等于大約 1 x108一種細胞類型的細胞,但僅等于 0.5 x108細胞。

要使用此功能,建議最初為每種細胞類型確定適當?shù)募毎麛?shù)轉(zhuǎn)換因子。構(gòu)建 OD 的校準曲線600值與瓊脂平板上生長的菌落形成單位的細胞數(shù)量相關(guān)。確保在適當時乘以稀釋因子。

酵母細胞通常比細菌細胞大。因此,OD600值 1 通常相當于酵母細胞比細菌細胞少。

最佳實踐

為確保最佳結(jié)果,以 OD 為目標600對于微量和比色皿模式,應(yīng)根據(jù)經(jīng)驗確定每種細胞類型的值。

比色皿模式(推薦)

  • 確保培養(yǎng)物充分混合,并且在從懸浮液中取出等分試樣之前,細胞尚未沉淀。

  • 確保預(yù)期的細胞密度在所選 DS-11 + 比色皿模式的線性范圍內(nèi)。

  • 使用高質(zhì)量的塑料比色皿或 Z 高度為 8.5 mm 的石英比色皿。

  • 每次樣品測量使用干凈的比色皿。根據(jù)制造商推薦的方案清潔比色皿。

  • 確保比色皿以正確的方向插入。

微量模式

  • 在進行空白測量之前清潔兩個樣品測量表面。

  • 確保培養(yǎng)物充分混合,并且在從懸浮液中取出等分試樣之前細胞尚未沉淀。

  • 確保預(yù)期細胞密度在所選 DS-11 / DS-11 + 微量模式的線性范圍內(nèi)。請記住,盡管微量模式可以測量具有非常高 OD 值的樣品,但培養(yǎng)物本身可能不會表現(xiàn)出對高細胞密度的線性響應(yīng)。

  • 確保每次測量時將完整的 1 μL 樣品輸送到樣品表面。

  • 每次測量使用新鮮的等分試樣。

  • 使用新鮮的吸頭將每個樣品等分試樣提供。

  • 將樣品移液到測量表面時避免引入氣泡。

  • 每次測量后,立即使用干燥的實驗室抹布從頂部和底部表面去除樣品。

不同波長的 OD

Formula Methods 應(yīng)用程序支持創(chuàng)建自定義方法和公式,包括用于測量 600 nm 以外波長下 OD 的方法和公式。例如,可以使用以下參數(shù)測量 650 nm 處的 OD:分析 nm = 650,基線 nm = 留空,最小 nm = 550,最大 nm = 700。

DeNovix DS-11 系列儀器能夠使用預(yù)配置的 OD 測量酵母和微生物培養(yǎng)物600應(yīng)用程序。

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